Augsburg Üniversitesi'nin yedi fakültesi vardır: İktisat Fakültesi, Hukuk Fakültesi, Katolik ve İlahiyat Fakültesi, Felsefe ve Sosyal Bilimler Fakültesi, Filoloji ve Tarih Fakültesi, Matematik ve Doğa Bilimleri Fakültesi ve Uygulamalı Bilgisayar Bilimleri Fakültesi. Fakülteler birçok alanda yakın işbirliği içinde çalışmaktadır. Araştırma ve öğretimde disiplinlerarasılık, günlük işlerin bir parçasıdır. Kurs için bunun anlamı: Tüm fakültelerde dersi yoğunlaştıran ve hızlandıran yeni öğretim biçimleri geliştirilmektedir.
Kurs yelpazesi, esasen Augsburg Üniversitesi'nin profilini belirleyen ve sürekli geliştirilen üç ana araştırma ve öğretim alanına dayanmaktadır: kültürel ve sosyal bilimler, yenilikçi teknolojiler ve akademik öğretmen eğitimi.
