Württemberg Evanjelik Devlet Kilisesi'nin Tübingen Üniversitesi Kilise Müziği Üniversitesi, 1998 yılında Esslingen am Neckar'daki Kilise Müziği Üniversitesi'nden 1945'te bir kilise müzik okulu olarak kurulmuştu. Bu üniversitede koro yöneticileri, orgcular ve kantorlar öncelikle kilise hizmeti için eğitildi. Eğitim kursları genellikle kilise müziği A sınavı, B sınavı ve diğer ilgili derecelerle sona erdi. Esslingen Kilisesi Müzik Okulu, 1989'da Kilise Müzik Üniversitesi'ne yükseltildi. 1995'te, kilise müziği çalışmaları konu kanonuna popüler müziği dahil eden Almanya'daki ilk üniversite oldu. 1998 sonbaharında Tübingen'e taşındı ve 2009'dan beri kilise sponsorluğuyla devlet tarafından tanınan bir üniversite oldu.
Protestan Kilisesi Müziği-B'deki temel kursa ve Protestan Kilisesi Müziği-A'daki yüksek lisans kursuna ek olarak, üniversite şu anda organ edebiyatı çalma, organ doğaçlama, koro şefliği ve kilise popüler müziği alanlarında daha fazla lisansüstü kurslar sunmaktadır. Mevcut diploma ve lisansüstü dersler, 2012 sonbaharından itibaren yeni tasarlanmış Lisans ve Yüksek Lisans kurslarına dönüştürülecektir.
