Bir Bundeswehr üniversitesinin en bariz özelliği, özel çalışma organizasyonudur. Bir akademik yıl üç aylık dönemlere, yani her biri on iki haftalık üç ders bloğuna, ardından yılda yalnızca bir dersten muaf dönemlere bölünür. Universität der Bundeswehr Hamburg'daki tüm kurslar, öğrencilerin akademik yıl başına 75 kredi puanına kadar kazanabilecekleri yoğun kurslar olarak tasarlanmıştır. Bu nedenle kurs, devlet üniversitelerinden önemli ölçüde daha kısadır. Lisansın 180. kredi puanını 7. trimesterde (veya en geç 8. trimesterde) alan ve gerekli minimum notu elde eden her öğrenci otomatik olarak Yüksek Lisans derecesi için bir yer alacaktır.
